“金税三期”就是在“以票控税”的指导思想下，建设的覆盖各级税务机关、所有税种、所有工作环节的全国性税收信息系统。2018年8月，“金税三期”系统已升级为“自然人税收管理系统扣缴客户端”，功能更加强大。应用网络发票系统可以杜绝虚开、代开、开具“大头小尾”发票的违法行为，帮助企业规避不法分子利用假票骗税所带来的财务风险，保护企业的合法经济利益。“金税三期”具体的作用如下。

（1）“金税三期”产生的数据会成为税务稽查和纳税评估的数据来源，政府税收管理的针对性更强。

（2）“金税三期”使得发票开具与发票数据上传实现即时性，会时刻提醒纳税人可能存在的涉税问题。

（3）“金税三期”对增值税专用发票采用全要素认证，包括企业之间业务关联性、货物或劳务与本企业产品或服务的相关性、滞留票等，会对税收监管产生巨大影响。

（4）“金税三期”将职工的工资薪金税前扣除金额与个人所得税申报情况，以及“五险一金”的缴纳情况实现相互监督和关联，税务稽查的针对性更强。

（5）“金税三期”上线后，对企业应当进行调整而没有申报调整的大多数事项能够自动提示，可以提高税收管理的效率。

（6）“金税三期”上线后，国税、地税合并数据完成对接，原来漏掉的涉税问题可能会被梳理出来。

（7）“金税三期”上线后，费用与生产经营活动的相关性分析会加强，包括费用发生地点与交易对方是否相关、费用资本化与收益化的处理是否匹配、货物的进出相关性等。

（8）“金税三期”上线后，税务机关的自由裁量权受到限制，税收征管更为公平。

（9）“金税三期”上线后，税务机关对失控发票及异常凭证的管理措施更加严格。

（10）“金税三期”上线与电子发票推广对税务稽查提出了新的要求。

（11）“金税三期”上线后，股权转让成为税务关注点且暴露在税收监管下。

（12）“金税三期”上线后，企业必须关注财税风险防范，从事后控制转到事前控制，建立财税风险事前防范机制。