行政事业单位会计分为行政单位会计与事业单位会计两大体系，是各级行政机关、事业单位和其他类似组织核算、反映和监督单位预算执行及各项业务活动的会计专业，是预算会计的组成部分。
行政单位会计与事业单位会计虽然是两个不同的体系，但都属于预算会计的组成部分，两者的会计要素分类和主要账务处理方法相同，会计报表种类及主要项目也相同。
事业单位和行政单位存在很大的不同，具体如下。
1.内涵不同
行政单位是国家机关，而事业单位是实施政府某项公共服务的部门，是社会服务组织。
2.担负的职责不同
行政单位负责对国家各项行政事务进行组织、管理和指挥，而事业单位为了社会的公益目的从事教育、文化、卫生、科技等活动。
3.编制和工资待遇的来源不同
行政单位使用行政编制，相关经费由国家行政经费负担。事业单位使用事业编制，相关经费由国家事业经费负担。行政单位的工作人员的工资按《中华人民共和国公务员法》的规定由国家负担；事业单位则根据不同的管理模式对其工作人员实行不同的待遇。